Hrvatski registar brodova će, počevši od 25. svibnja 2018., u svoje poslovanje implementirati uredbu Europske unije o zaštiti osobnih podataka (GDPR) (EU) 2016/679. Hrvatski registar brodova se obvezuje poštivati anonimnost i privatnost korisnika ovih internetskih stranica te se o posjetiteljima neće prikupljati nikakvi osobni podaci, osim u slučajevima ako ih posjetitelj dobrovoljno dostavi Hrvatskom registru brodova.
Hrvatski registar brodova takve podatke može koristiti i za što bolji uvid i razumijevanja pojedinačnih potreba i zahtjeva korisnika kao i razvijanja mogućnosti što kvalitetnijeg pružanja svojih usluga korisnicima.
Hrvatski registar brodova se obvezuje da navedene podatke neće učiniti dostupnim bilo kojoj trećoj osobi odnosno strani bez izričitoga pristanka korisnika.